เนื้อหา
- ความแตกต่างหลัก
- แผนภูมิเปรียบเทียบ
- Genomic Library คืออะไร
- cDNA Library คืออะไร
- Genomic Library vs. cDNA Library
ความแตกต่างหลัก
Genomic library และ CDNA library ใช้ในการโคลนยีนเพื่อแยก DNAs ที่แตกต่างกัน ความแตกต่างที่สำคัญระหว่างห้องสมุดทั้งสองนี้คือห้องสมุดจีโนมมีชิ้นส่วนดีเอ็นเอที่แสดงจีโนมทั้งหมดของสิ่งมีชีวิตในขณะที่ในห้องสมุด cDNA, mRNA นำมาจากเซลล์เฉพาะของสิ่งมีชีวิตและจากนั้น cDNA ทำจาก mRNA นั้นในปฏิกิริยา เร่งปฏิกิริยาด้วยเอนไซม์
แผนภูมิเปรียบเทียบ
ห้องสมุดจีโนม | cDNA Library | |
คำนิยาม | ห้องสมุดจีโนมคือชุดของจีโนมดีเอ็นเอทั้งหมดจากสิ่งมีชีวิตเดี่ยว DNA จะถูกเก็บไว้ในประชากรที่มีเวกเตอร์ที่คล้ายกันซึ่งแต่ละอันมี DNA ที่แตกต่าง | ห้องสมุด CDNA คือการรวมกันของชิ้นส่วน CDNA โคลนที่แทรกเข้าไปในคอลเลกชันของเซลล์โฮสต์ซึ่งร่วมกันทำให้บางส่วนของ transcriptome ของสิ่งมีชีวิต |
การแสดงออก | จีโนมทั้งหมด | ยีนที่เฉพาะเจาะจงเท่านั้น |
ขนาด | ขนาดใหญ่ที่สุด | ที่มีขนาดเล็ก |
introns | นำเสนอ | ขาด |
เวกเตอร์ | มันใช้พลาสมิด, คอสมิด, แลมบ์ดาฟาจ, YAC และ BAC สำหรับที่พักของชิ้นส่วนขนาดใหญ่ | ไม่มีอินตรอนดังนั้นให้ใช้พลาสมิดพลาสมิดแลมบ์ฟาจแลพเพื่อใช้เป็นชิ้นเล็ก ๆ |
Genomic Library คืออะไร
ในกระบวนการโคลนยีนยีนที่น่าสนใจจะถูกคัดลอกจาก DNA ที่แยกออกจากสิ่งมีชีวิต เมื่อ DNA ถูกแยกออกจากสิ่งมีชีวิตยีนทั้งหมดของมันจะถูกดึงออกมาในคราวเดียว DNA ของสิ่งมีชีวิตประกอบด้วยยีนต่าง ๆ นับพัน วิศวกรพันธุศาสตร์ค้นหายีนที่เฉพาะเจาะจงหนึ่งตัวซึ่งเข้ารหัสโปรตีนเฉพาะที่น่าสนใจ ไม่มีเทคนิคใดที่ยีนเฉพาะจาก DNA สามารถพบได้ดังนั้นนักวิทยาศาสตร์จึงสร้างห้องสมุดยีนเพื่อทำแคตตาล็อก DNA ของสิ่งมีชีวิต นักวิทยาศาสตร์แล้วเลือกยีนที่ต้องการจากห้องสมุด ห้องสมุดยีนเป็นกลุ่มของแบคทีเรียที่มีชีวิตซึ่งได้รับการแปลงร่างด้วยดีเอ็นเอที่แตกต่างจากสิ่งมีชีวิตที่เป็นแหล่งของยีนที่ต้องการ DNA ถูกดึงออกมาจากสิ่งมีชีวิตเพื่อสร้างห้องสมุดซึ่งเป็นรูปแบบที่เป็นระเบียบของ DNA Genomic library และ cDNA เป็นห้องสมุดยีนสองประเภท เทคนิคต่าง ๆ ของการโคลนยีนถูกใช้เป็นกลยุทธ์ของยีนในเทคโนโลยีรีคอมบิแนนท์ ชิ้นส่วนดีเอ็นเอถูกแยกออกโดยการตัดด้วยเอ็นไซม์ จำกัด เฉพาะจาก DNA แม่ ชิ้นส่วนเหล่านี้จะถูกรวมเข้าไปในโมเลกุลเวกเตอร์และโมเลกุลที่รวบรวมจะถูกถ่ายโอนไปยังเซลล์เจ้าบ้านหนึ่งโมเลกุลในแต่ละเซลล์ ห้องสมุดจีโนมประกอบด้วยอินตรอนดีเอ็นเอขยะและชิ้นส่วนอื่น ๆ อีกมากมาย ในห้องสมุดนี้ DNA ถูกแบ่งออกเป็นชิ้นส่วนเล็ก ๆ ภายในเซลล์ หลังจากนี้ส่วนเล็ก ๆ ทั้งหมดจะถูกแทรกเข้าไปในเวกเตอร์เพื่อสร้างห้องสมุด ห้องสมุดจีโนมมี DNA ทั้งหมดของเซลล์ทั้งหมดและยีนประกอบด้วยอินตรอนทั้งหมด จีโนมดีเอ็นเอเป็นการแปลจีโนมทั้งหมด มันไม่ได้เข้ารหัสส่วนทั้งหมดใน codon เดียวเนื่องจากขนาดของ introns ไม่มีกลไกการต่อรอยในห้องสมุดจีโนมซึ่งทำให้เกิดความยากลำบากในการแสดงออกของยีนที่นำมาจากห้องสมุดนี้
cDNA Library คืออะไร
cDNA library ถูกสร้างขึ้นโดยการเลือกเซลล์หรือเนื้อเยื่อชนิดหนึ่ง จากนั้น mRNA จะถูกแยกออกจากเซลล์หรือเนื้อเยื่อนั้น สำเนา DNA ของโมเลกุล mRNA นั้นทำโดยใช้เอ็นไซม์ reverse transcriptase enzyme ดังนั้น cDNA library จึงมี DNA เฉพาะที่มีอยู่ใน mRNA ไม่มี introns และไม่มีลำดับ DNA อยู่ในไลบรารีนี้ ในไลบรารีนี้โคลนทั้งหมดมีความยาวเต็ม ยิ่งไปกว่านั้น cDNA clone นั้นจำเป็นต่อการตัดต่อเซลล์เพื่อผลิตโปรตีนหรือตรวจจากเซลล์
Genomic Library vs. cDNA Library
- จีโนมไลบรารีประกอบด้วย DNA ของจีโนมโดยตรง
- cDNA Library ถูกสร้างขึ้นโดยใช้ mRNA เป็นเทมเพลต
- ห้องสมุดจีโนมเป็นการแสดงออกถึงจีโนมทั้งหมดของสิ่งมีชีวิต
- ไลบรารี cDNA แสดงเฉพาะยีนของเงื่อนไขเฉพาะ
- เอ็นไซม์สองชนิด, เอ็นโดนิเดสที่ จำกัด และลิแกนส์มีความสำคัญสำหรับการสร้างห้องสมุดจีโนม
- เอนไซม์ transcriptase ย้อนกลับมีบทบาทสำคัญในการสร้างไลบรารี cDNA
- Genomic library แสดง DNA ของสิ่งมีชีวิตทั้งโปรคาริโอตและยูคาริโอต
- cDNA library แสดงถึง DNA ของสิ่งมีชีวิตยูคาริโอตเท่านั้น
- ห้องสมุดจีโนมไม่สามารถแสดงออกในสิ่งมีชีวิตที่เป็นโปรคาริโอตได้เนื่องจากมีอินตรอนและสิ่งมีชีวิตแบบโปรคาริโอตไม่มีกลไกในการประมวลผลแบบอินตรอน
- cDNA ไลบรารี่มีความสามารถในการแสดงออกของจีโนมในแบคทีเรียซึ่งเป็นโปรคาริโอตเพราะขาดอินตรอน